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  • wwws_1224
    wwws_1224  : 肝癌—肠道菌群,一个是肝癌,一个肠道的细菌,位置都不同,这两个点是如何搭起来的呢?欢迎大家跟着我这篇帖子找答案。
  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 肠道菌群与肝癌 2天前

              上个月我就写了一篇帖子,《肠道菌群的研究策略》,里面提到了肠道菌群与肝癌这个研究热点,今天我在这里再把它完善一下。 肠菌研究现状与困局         首先还是看下我国18年肠菌研究的热度(这两年大文章不断,这里数据可能可能只是其中一部分),其实我今天的内容的也是针对这些人。           中文期刊中研究肠菌的方向,除了食品开发外,绝大多数是医学研究。这里超过80%仅用到16S测序技术,都停留在初级的细菌种属判定阶段;但随着测序的普及及科研水平的提高,16S测序的简单结果已不能满足科研要求了,于是有人转向了宏基因组,也有人转向

  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 代谢组学与中医现代性 3天前

            传统中医通过”望闻听切“等经验,依据《中医体质分类与判定》的评判方法,对我们的体质分了九类:湿热质、血瘀质、气虚质、阳虚质、气郁质、阴虚质等等?,这种评判标准客观吗?         中医的疾病诊断讲究病位、病因、病性、病势,中医的“证”就是上述种种的病理概括,是对内外环境变化和致病因素作出反应的一种变化的整体功能状态。这种状态有什么指标?       为了中医证型的标准化,许多学者一直尝试用各种手段进行检测,如流行病学、循证医学、数理统计学方法,并取得丰富成果,随着生物医学的发展,近年来更是在物质基础上做了许多尝试,如基因组学、转录组学、蛋白组学,虽然找到

  • wwws_1224
    wwws_1224  回复了帖子 代谢组学与中药现代化研究方法 5天前
         中药博大精深,有不同形态,如膏体,注射剂,粉剂等等,传统中药还讲究引药、复方的比例等等。中药西化只是最底层,还需更多的科学验证方法。       各事件的关系,除了小部分是因果关系,绝大部分是相关性。大数据分析是一种很好的科学研究方法,比如都是研究有效成分,可以比较经过煎煮后成分及含量的改变,复方之间相互协调的作用,引药的作用如此等等,都可以得到科学的验证。这些工作已经有不少中药学者在进行中,相信中药的后现代化进展会更快!
  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 代谢组学与中药现代化 9天前

    引子         近来朋友圈一篇文章引爆话题——《下一个农业灾难——中药材的大规模种植》,作为中国的魅宝,中药的历史价值不能否定,中药取之于源源不绝的天然产物,也在医药中一定会有一系之地。为了使中药能走向全世界,中药的现代化之路一直探索。        中药现代化,就是中药西化,主要研究中药的有效成分及药理作用。虽然缺失了很多传统中药的理论和精髓,但在药理上却能有科学的论证,在某一维度上为中药西化之路做了不小的贡献。今天主要讨论研究中药有效成分的研究方法。        传统炮制的理论依据        传统中药的分离有

  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 肠菌研究思路分享:菌群—糖尿病 17天前

              最近中科院生物物理所刘志华团队在《Cell Research》上发表文章,发现肠菌促进胰岛素分泌的机制。该工作入选2019年Cell Research第七期封面论文。          下面我们好好学习一下它的研究思路,同时可以对比上周的分析,好好体会他们的论证方法: Cell Research:肠菌促进胰岛素的分泌 ——Intestinal Lysozyme Liberates Nod1 Ligands From Microbes to Direct Insulin Trafficking in Pancreatic Beta Cells 期刊名:  

  • wwws_1224
    wwws_1224  回复了帖子 婴儿健康的关键—婴儿肠道菌群的建立 25天前
    最后一篇文献结果表明,喂养方式对菌群建立影响不大
  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 婴儿健康的关键—婴儿肠道菌群的建立 25天前

              一直关注肠菌与我们的健康,肠道菌群建立的过程是必不可少,婴儿肠菌菌群建立的研究也比较深入,刚好是我所期待的,现总结一下:1、婴儿肠道菌群的建立过程:出生前胎儿肠道无菌,出生后开始有环境微生物定植到2岁左右,菌群结构保持稳定和动态平衡2、婴儿肠菌的影响因素:胎儿期的影响(宫内接触、孕妇饮食、抗生素)分娩方式(顺产菌多样性高于剖宫产,接受带有产道微生物的纱布搽拭的剖宫产婴儿的菌群,比未接受的多样性高)喂养方式(母乳比配方奶产生的益生菌多)胎龄 (母体羊水菌群异常会导致早产)遗传基因 (同卵双胞胎菌群结构高于异卵双胞胎)3、婴儿肠菌与疾病新生儿患坏死性小肠结肠炎(NEC),一般是早产儿,原因是菌群失调,早发型是因早期厌氧芽孢杆菌

  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 肠道菌群研究方法的发展历程 26天前

    根据历程和成本对肠菌研究手段做一总结1、分离培养——对氧气依耐程度,分为好氧菌、兼氧菌和厌氧菌         成本低,检测种类少,简单鉴定方法是革兰氏染色法,根据细胞壁结构分为G+和G-2、传统分子生物学方法——PCR技术的应用       以16S rRNA为基础的分子方法有DGGE、TGGE、实时荧光定量PCR和分子标记技术等。其中DGGE在动物肠道微生物多样性方面运用较多,稍微讲解一下。从复杂微生物集合中提取基因组DNA用特异性引物进行PCR扩增,混合的PCR产物在变性线性梯度变化的聚丙酰胺凝胶中进行电泳结果:大小相同序列不同的DNA片段在变性凝胶的位置不同,条带的数目和亮度反映菌种类和菌结构将

  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 肠菌研究思路分享:“菌群—肠—脑”轴 31天前

            Cell:肠道微生物群介导生酮饮食的抗癫痫作用( The Gut Microbiota Mediates the Anti-Seizure Effects of the Ketogenic Diet ) 期刊名:    cell,IF31.2发表时间:2018-7技术平台:LC-MS代谢组+16S测序材  料:    生酮饮片(KD)、CD、无菌(GF)小鼠、SPF级小鼠、Kcna1 -/-小鼠 研究背景:生酮饮片(KD)是治疗癫痫(还有自闭症和阿尔兹海默症)的有效方法,但机制不清楚,肠道

  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 有趣的大脑十个冷门知识 32天前

    1. 大脑感觉不到疼痛尽管是它负责处理来自其他身体部位的信号,但就大脑而言,奇怪的是,它竟然无法感到疼痛。2. 压力可导致大脑萎缩若干研究已经得出结论,压力对我们的大脑有着负面的影响,可减小大脑体积。3. 15瓦成人的大脑一天只消耗250-300千卡。也就是说,一个重量介于1300-1400克(成人大脑的平均重量)的大脑的功率约为15瓦特。大脑所消耗的能量相当于2个大香蕉的能量。虽然并不是很多,但与身体总消耗的能量相比,确实是很多,因为完全运转的身体的功率才70瓦特。4. 数千公里长的神经细胞和无休止的神经再生据估计,人类大脑拥有1000亿个神经细胞,如果把他们排成一条直线,长度将达到1000公里。然而,由于神经细胞是高度分化的细胞,无法再生。但是体育锻炼能激发大脑的创造力。5. 切断与改造

  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 统计学的意义——现代科研方法的打开方式 33天前

               自从学了代谢组学,突然对统计学感触良多!今天就说说它的伟大意义。           六度关系理论——“地球上任意两个人之间的关系不超过六个人”。这世上人人都可以建立起链接,或直接或间接,数据也是一样,比如雾霾与肺炎,吸烟与短寿,熬夜与肥胖,甚至不吃早餐与肥胖,等等都有关系。那么它们的联系是如何建立起来的,万能工具就是——统计学。今天就谈谈我们科研中是如何应用统计学方法的。经典的生物学关系——因果关系            两个事物(现象)的联系通过简单的节点,能够用直线串联起来。比如,感冒会

  • wwws_1224
    wwws_1224  回复了帖子 肠道菌群最近大热,肠道菌的几个冷门知识你知道多少 34天前
    肠道菌群其实概念听宽泛的,包括细菌真菌病毒病原虫及其他无法分类鉴定的微生物
  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 肠道菌群最近大热,肠道菌的几个冷门知识你知道多少 34天前

    一、成人体内细菌为1.2kg,约100万亿(10^15个)二、肠道菌群占比80%,有400-500种,占粪便的1/3-2/5三、生理作用——(营养吸收、生长发育、生物屏障、免疫调节、脂肪代谢、抗肿瘤)生物拮抗作用:抵御有害病原微生物(沙门氏菌),维持菌群平衡        A、生物屏障:竞争黏附,形成微菌落及生物膜,产生定植抗力        B、化学屏障:产生有害代谢物,抑制其他细菌        C、营养竞争作用2、促进发育作用:(独有的短链脂肪酸,促进上皮细胞的生长与分化)(维生素)(合成必须的氨基酸)3、营养代谢作用:(特有的酶,分解不

  • wwws_1224
    wwws_1224  回复了帖子 肠菌的研究策略(持续更新...) 39天前
    菌群研究里程碑四:菌群对免疫系统的调节1、 1989年,“卫生假说”被提出,随后的相关研究发现,菌群在免疫耐受的建立中发挥重要作用;2、 同样在1989年,Charles Janeway提出免疫细胞通过模式识别受体感知菌群信号以启动免疫应答;3、21世纪初的许多研究表明,粘膜免疫系统对共生菌群的应答并非一种宿主防御方式,而是一种宿主与菌群共生的生理过程;4、随后,更多的研究开始揭示菌群-免疫互作的机制,包括共生细菌调节小肠中Th17细胞分化、肠道菌群代谢产物介导免疫耐受等。Rakoff-Nahum, S. et al. Recognition of commensal microflora by toll-like receptors is required for intestinal h
  • wwws_1224
    wwws_1224  回复了帖子 肠菌的研究策略(持续更新...) 44天前
    ——摘录热心肠公众号菌群研究里程碑一:粪菌移植       1958年Eiseman报道了用健康人粪便灌肠的粪菌移植(FMT)方法,成功治疗4例伪膜性肠炎:1、其病原菌是产生肠毒素的艰难梭菌,可引起腹泻和结肠慢性炎症,抗生素是艰难梭菌感染(CDI)标准治疗方法,但会抑制肠道菌群,易导致艰难梭菌的后续爆发性生长;2、 FMT能重建肠道菌群的正常功能,通过多种机制抑制艰难梭菌,临床试验显示,包括口服胶囊在内的FMT可有效治疗复发性CDI       结论: FMT是溃疡性和药物导致的结肠炎等疾病的潜在疗法。菌群研究里程碑二:利用无菌动物研究菌群的作用     1965年,Sch
  • wwws_1224
    wwws_1224  发布了新帖 肠菌的研究策略(持续更新...) 46天前

           近年来肠道菌群的研究非常火爆,肠菌大会的规格越来越高。主要原因是肠菌与绝大多数疾病的发生发展密切相关,涵盖的疾病谱包括中枢性疾病(自闭症,帕金森氏病)、慢性代谢性疾病(肥胖、脂肪肝、糖尿病、高血压、心血管疾病、高脂血症等)、呼吸系统疾病、免疫性疾病、恶性肿瘤(肝癌等)等等,而且,肠道菌稳态与失衡更是影响药物药效及毒副作用的重要因素。此外,肠道菌群还是探索中医学理论与中药药效机制研究的重要突破口。      在肠道菌群的研究中,最为热门的研究手段就是16S(宏基因组)和代谢组学,它们从肠道菌的“结构”和“功能”两个方面揭示肠道菌在疾病发生发展中的神秘面纱,它们是探索肠道菌参与疾病发病与药效机制的关键手

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